O TCU (Tribunal de Contas da União) questionou a CBTU em relação às funções TGE, ASO-Manobra, e ASM do PES 2010. Segundo o entendimento do Tribunal, houve ascensão funcional o que não é permitido em uma empresa pública. A CBTU apresentou sua argumentação defendendo as funções estabelecidas e aguarda pronunciamento do Tribunal.